Oxford Nanopore
Наборы подготовки библиотек Ligation, Rapid и Rapid PCR Barcoding
Подготовка библиотеки ДНК от 10 минут: выбор между максимальным выходом и скоростью
Наборы Oxford Nanopore для лигазной, Rapid- и баркодированной подготовки библиотек дают выбор между максимальным выходом, скоростью и мультиплексированием.
Запросить КПЛигазные наборы сохраняют длину входных фрагментов и ориентированы на высокий выход; Rapid-химия сокращает подготовку примерно до 10 минут; баркодирование объединяет несколько образцов в одной ячейке. Выбор набора зависит от типа образца и требуемой глубины.
В официальной линейке: Ligation Sequencing Kit — около 60 мин и примерно 1 мкг gDNA; Rapid Sequencing Kit — около 10 мин и примерно 200 нг gDNA; Rapid PCR Barcoding — около 15 мин плюс ПЦР и 1–5 нг gDNA. Совместимость проверяется по версии поры и химии.
Выбор под задачу
- Лигазные наборы сохраняют длину входных фрагментов ДНК и дают максимальный выход
- Rapid-химия сокращает подготовку примерно до 10 минут
- Баркодирование объединяет несколько образцов в одной проточной ячейке
Производительность
- Ligation Sequencing Kit: около 60 минут, вход около 1 мкг гДНК (или 100–200 фмоль для ампликонов)
- Rapid Sequencing Kit: около 10 минут, вход около 200 нг гДНК (или 50 нг для ампликонов)
- Rapid PCR Barcoding Kit: около 15 минут плюс ПЦР, вход 1–5 нг гДНК
Совместимость
- Требуют проточных ячеек для ДНК (MinION, PromethION, Flongle Flow Cell)
- Совместимость проверяется по версии поры и текущей версии химии
Подготовка библиотеки
| Параметр | Ligation Sequencing Kit | Rapid Sequencing Kit | Rapid PCR Barcoding Kit |
|---|---|---|---|
| Время подготовки | около 60 мин | около 10 мин | около 15 мин + ПЦР |
| Входной материал | ~1 мкг гДНК (100–200 фмоль для ампликонов) | ~200 нг гДНК (50 нг для ампликонов) | 1–5 нг гДНК |
| Длина прочтения | равна длине входного фрагмента | случайное распределение в зависимости от длины фрагмента | ~2 кб |
| Требуется ПЦР | нет | нет | да |
| Ключевое преимущество | максимальный выход | самая быстрая подготовка | минимальные требования по входу |
Совместимость
| Параметр | Ligation Sequencing Kit | Rapid Sequencing Kit | Rapid PCR Barcoding Kit |
|---|---|---|---|
| Тип проточной ячейки | ДНК-ячейки (MinION, PromethION, Flongle) |