Oxford Nanopore
Набор подготовки библиотек Direct RNA Sequencing Kit
Прямое секвенирование нативной РНК без обратной транскрипции и ПЦР
Direct RNA Sequencing Kit позволяет читать нативную РНК напрямую, сохраняя информацию о длине молекулы и модификациях.
Запросить КПМетод не требует обратной транскрипции для формирования последовательности и помогает исследовать изоформы, поли(А)-хвосты и модификации в одной постановке. Для прямой РНК используется соответствующая RNA Flow Cell.
Ориентировочная подготовка 135 мин; вход — около 300 нг poly(A)+ RNA или 1 мкг total RNA. Длина прочтения соответствует длине исходной РНК; ПЦР не требуется. Конкретный артикул набора и совместимая ячейка фиксируются по текущей версии химии.
Метод
- Секвенирование выполняется напрямую с молекулы РНК, без этапа обратной транскрипции
- ПЦР-амплификация не требуется
- Длина прочтения соответствует длине исходной молекулы РНК
Возможности анализа
- Позволяет исследовать изоформы транскриптов и поли(А)-хвосты
- Даёт доступ к модификациям оснований в составе нативной молекулы РНК
Совместимость
- Требует проточной ячейки для direct RNA (RNA-вариант MinION, PromethION или Flongle Flow Cell)
Подготовка библиотеки
| Параметр | Direct RNA Sequencing Kit |
|---|---|
| Время подготовки | около 135 мин |
| Входной материал | ~300 нг poly(A)+ РНК или 1 мкг суммарной РНК |
| Требуется ПЦР | нет |
| Длина прочтения | соответствует длине исходной РНК |
Совместимость
| Параметр | Direct RNA Sequencing Kit |
|---|---|
| Тип проточной ячейки | RNA-вариант проточных ячеек (MinION, PromethION, Flongle) |