NanoString Technologies
Система пространственной визуализации CosMx Spatial Molecular Imager
Одноклеточная и субклеточная пространственная транскриптомика и протеомика: свыше 19 000 РНК-мишеней
NanoString CosMx SMI от Bruker Spatial Biology — интегрированная система пространственной транскриптомики и протеомики с одно-клеточным и субклеточным разрешением для исследования ткани без утраты её архитектуры.
Запросить КППлатформа использует циклическую флуоресцентную гибридизацию in situ и высокоразрешающую визуализацию для локализации РНК и белков непосредственно в FFPE- и свежезамороженных тканях, органоидах и культурах клеток. Алгоритмы сегментации определяют границы клеток и относят отдельные транскрипты к конкретным клеткам и внутриклеточным областям. AtoMx Spatial Informatics Platform обеспечивает облачное хранение, обработку, визуализацию и анализ данных исследования.
CosMx SMI поддерживает таргетные панели до 6000 РНК-мишеней, полнотранскриптомный анализ более 19 000 РНК и одновременное измерение 64+ белков. Пространственное разрешение — 120 нм, точность локализации транскрипта — менее 50 нм; анализируется до 3 млн клеток на стекло, до четырёх стёкол за запуск и до 26 стёкол в неделю. Площадь сканирования достигает 300 мм² на стекло. Система предназначена только для исследовательского применения и поставляется как комплекс прибора, валидированных панелей и реагентов и платформы AtoMx SIP.
Разрешение
- Циклическая флуоресцентная гибридизация in situ
- Пространственное разрешение 120 нм, точность локализации транскрипта менее 50 нм
- Сегментация клеток и привязка транскриптов к внутриклеточным областям
Мультиплексирование
- Таргетные РНК-панели до 6000 мишеней
- Полнотранскриптомный анализ более 19 000 РНК
- Одновременное измерение 64+ белковых мишеней
Производительность и данные
- До 3 млн клеток на стекло, до 4 стёкол за запуск, до 26 стёкол в неделю
- Площадь сканирования до 300 мм² на стекло
- Облачная платформа AtoMx Spatial Informatics Platform для хранения и анализа данных
Визуализация
| Параметр | CosMx SMI |
|---|---|
| Метод | циклическая флуоресцентная гибридизация in situ |
| Пространственное разрешение | 120 нм |
| Точность локализации транскрипта | менее 50 нм |
Мультиплексирование
| Параметр | CosMx SMI |
|---|---|
| РНК, таргетные панели | до 6000 мишеней |
| РНК, полный транскриптом | более 19 000 мишеней |
| Белок | 64+ мишеней одновременно |
Производительность
| Параметр | CosMx SMI |
|---|---|
| Клетки на стекло | до 3 млн |
| Стёкол за запуск | до 4 |
| Стёкол в неделю | до 26 |
| Площадь сканирования | до 300 мм² на стекло |
Платформа
| Параметр | CosMx SMI |
|---|---|
| Программное обеспечение | AtoMx Spatial Informatics Platform (облачное) |
| Область применения | только для научных исследований (RUO) |