Bruker
Система FT-IR типирования штаммов IR Biotyper
Типирование штаммов за часы, а не дни: 30 изолятов от культуры до результата за ~3 ч
FT-IR система для быстрого типирования штаммов и поддержки эпидемиологического контроля в реальном времени.
Запросить КПIR Biotyper регистрирует инфракрасный молекулярный отпечаток микроорганизма и классифицирует изоляты по сходству. Решение помогает выявлять кластеры, отслеживать пути передачи и проводить рутинный скрининг без длительных молекулярных процедур.
Измерение одного пятна занимает около одной минуты; результат для 30 образцов может быть получен менее чем за три часа. Используется многоразовая кремниевая пластина на 96 позиций; анализ основан на FT-IR спектроскопии, включая диагностически значимую область 900–1200 см⁻¹.
Скорость
- Одно пятно измеряется примерно за минуту, весь планшет — около 90 минут
- Партия из ~30 изолятов в трёх повторах вместе со стандартами проходит путь от культуры до результата примерно за 3 часа
- Типирование в реальном времени позволяет реагировать на вспышку до её распространения
Аналитические возможности
- Разрешающая способность сопоставима с рутинными молекулярно-генетическими методами
- По умолчанию анализируется «отпечаточная» область полисахаридов 900–1200 см⁻¹; доступны области белков и жирных кислот
- Функция IR Tracker (алгоритм kNN) ранжирует изоляты по родству и выделяет совпадения цветом
- Классификация по встроенным и собственным моделям: ИНС, SVM, random forest
Интеграция и экономичность
- Импорт идентификаций MALDI Biotyper и экспорт результатов в LIMS в формате CSV
- Многоразовые кремниевые планшеты на 96 позиций
- Не требует сложной биоинформатики и мощной ИТ-инфраструктуры
Измерение
| Параметр | IR Biotyper |
|---|---|
| Метод | инфракрасная спектроскопия с преобразованием Фурье (FT-IR) |
| Основная спектральная область | 900–1200 см⁻¹ (полисахариды); дополнительно 1500–1800 см⁻¹ (белки) и 2800–3000 см⁻¹ (жирные кислоты) |
| Время измерения | ~1 мин на пятно; ~90 мин на полный планшет |
| Производительность рабочего процесса | до 30 изолятов (по 3 повтора) за ~3 ч |
Образцы
| Параметр | IR Biotyper |
|---|---|
| Формат | кремниевый микротитровальный планшет на 96 пятен, многоразовый |
| Пробоподготовка | суспензия чистой культуры во флаконах IR Biotyper Kit, нанесение и высушивание |
Программное обеспечение
| Параметр | IR Biotyper |
|---|---|
| Анализ | PCA (2D/3D), дендрограммы, матрицы расстояний, IR Tracker |
| Классификация | ИНС, SVM, random forest; встроенные классификаторы с регулярными обновлениями |
| Обмен данными | импорт из MALDI Biotyper, экспорт в LIMS (CSV) |
| Статус | не предназначен для клинической диагностики |