Bruker
Программное обеспечение IR Biotyper 4.0
Кластеры, дендрограммы и классификация изолятов в реальном времени — прямо во время прогона
Программный пакет IR Biotyper 4.0 превращает FT-IR спектры изолятов в наглядные кластеры и отвечает на главный вопрос инфекционного контроля — один ли это штамм.
Запросить КППО управляет измерениями на IR Biotyper, сравнивает спектральные профили методами PCA и LDA и классифицирует изоляты с помощью нейронных сетей и метода опорных векторов. Результаты показываются уже во время прогона в цветовой схеме и доступны в виде дендрограмм, матриц расстояний и 2D/3D графиков; идентификации MALDI Biotyper импортируются, а итоговые данные выгружаются в LIMS.
Пакет работает под Windows 10 и требует OPUS 8.2 или выше с лицензиями OPUS/IT, OPUS/MAP и OPUS/SEARCH; в поставку входит одна пользовательская лицензия. Поддерживаются неограниченные метаданные изолятов для эпидемиологических исследований. Продукт не предназначен для клинической диагностики.
Анализ данных
- Статистические методы PCA и LDA для сравнения спектральных профилей
- Представление результатов в виде дендрограмм, матриц расстояний, 2D- и 3D-диаграмм
- Выбор спектральной области анализа: полисахариды, белки или жирные кислоты
Классификация
- Обучаемые классификаторы на основе искусственных нейронных сетей и метода опорных векторов
- Результат классификации выводится сразу после измерения пятна в зелёно-жёлто-красной цветовой схеме
- Встроенные классификаторы регулярно обновляются производителем
Работа с данными
- Неограниченные метаданные изолятов: факторы вирулентности, резистентность, место и дата выделения
- Импорт идентификаций MALDI Biotyper
- Экспорт результатов в LIMS
Функции
| Параметр | IR Biotyper 4.0 |
|---|---|
| Статистический анализ | PCA, LDA |
| Контролируемая классификация | искусственные нейронные сети (ANN), метод опорных векторов (SVM) |
| Визуализация | дендрограммы, матрицы расстояний, 2D/3D диаграммы рассеяния |
| Отображение результатов | в ходе прогона, после каждого пятна, цветовая кодировка |
Совместимость
| Параметр | IR Biotyper 4.0 |
|---|---|
| Прибор | IR Biotyper |
| Операционная система | Windows 10 |
| Зависимости | OPUS 8.2 или выше с лицензиями OPUS/IT, OPUS/MAP, OPUS/SEARCH |
| Лицензии в комплекте | 1 пользовательская |
| Обмен данными | импорт идентификаций MALDI Biotyper, экспорт в LIMS |
| Статус | не предназначено для клинической диагностики |