Agena Bioscience
Система генотипирования MassARRAY
Мультиплексный MALDI-TOF генотип-анализ: до 384 образцов за цикл без секвенирования
Agena Bioscience MassARRAY — открытая платформа таргетного генетического анализа на основе MALDI-TOF масс-спектрометрии. Она объединяет высокую мультиплексность, форматы 96 и 384 лунок и понятный рабочий процесс для генотипирования, онкологических, фармакогенетических и эпигенетических исследований.
Запросить КППосле ПЦР и обработки SAP выполняется одноосновное удлинение праймера; Chip Prep Module автоматически кондиционирует продукты реакции и переносит их на SpectroCHIP. MassARRAY Analyzer 4 регистрирует различия массы продуктов методом MALDI-TOF, а программное обеспечение Typer преобразует спектры в результаты по вариантам. Платформа применяется для SNP и инделов, соматических мутаций, транслокаций, вариаций числа копий и метилирования и не требует секвенирования каждого образца.
Текущая система включает MassARRAY Analyzer 4, Chip Prep Module в конфигурации 96 или 384 и интегрированный компьютер. Поддерживаются микропланшеты и SpectroCHIP на 96 или 384 образца; ёмкость загрузки — две микропланшеты и два массива. Типичное время детекции составляет около 100 минут для 96-луночного и около 150 минут для 384-луночного формата, последующий анализ занимает 5–10 минут. Габариты комплекса — 104 × 110 × 68 см. Для большинства исследований производитель указывает ввод 10–40 нг ДНК на реакцию; точные требования зависят от химии и панели. Система предназначена для исследовательского применения, если конкретная конфигурация и набор не имеют отдельного диагностического статуса.
Производительность
- Формат 96: время обработки ~100 минут на планшет, ручное время ~25 минут
- Формат 384: время обработки ~150 минут на планшет, ручное время ~45 минут
- Chip Prep Module 384 обрабатывает до 6–8 планшетов на 384 лунки за смену/сутки
Технология детекции
- Одноосновное удлинение праймера после ПЦР и обработки SAP, без флуоресцентных меток
- MALDI-TOF детекция различий массы продуктов на MassARRAY Analyzer 4
- Программное обеспечение Typer автоматически преобразует спектры в результаты по вариантам
Автоматизация и интеграция
- Непрерывная загрузка образцов минимизирует простои между партиями
- Встроенная система хранения поддерживает температуру образцов для ночных прогонов
- Ёмкость загрузки — две микропланшеты и два массива SpectroCHIP одновременно
Производительность
| Параметр | MassARRAY System с Chip Prep Module 96 | MassARRAY System с Chip Prep Module 384 |
|---|---|---|
| Формат SpectroCHIP | 96 | 384 |
| Время обработки планшета | ~100 мин | ~150 мин |
| Ручное время | ~25 мин | ~45 мин |
| Последующий анализ данных | 5–10 мин | |
| Пропускная способность Chip Prep Module | — | до 6–8 планшетов на 384 лунки за смену/сутки |
Система
| Параметр | MassARRAY System с Chip Prep Module 96 | MassARRAY System с Chip Prep Module 384 |
|---|---|---|
| Компоненты | MassARRAY Analyzer 4, Chip Prep Module, интегрированный компьютер | |
| Ёмкость загрузки | 2 микропланшеты + 2 массива SpectroCHIP | |
| Габариты | 104 × 110 × 68 см | |
| Входная ДНК на реакцию | 10–40 нг (зависит от химии и панели) | |
| Мультиплексность на позицию | до 50 вариантов | |
| Программное обеспечение | Typer (анализ и отчётность) |
Применение
| Параметр | MassARRAY System с Chip Prep Module 96 | MassARRAY System с Chip Prep Module 384 |
|---|---|---|
| Статус | для исследовательского применения (RUO); отдельные конфигурации и наборы могут иметь диагностический статус |