Agena Bioscience
Наборы реагентов для MassARRAY: iPLEX, UltraSEEK, EpiTYPER
Набор химий MassARRAY для генотипирования от рутинных вариантов до мутаций с долей 0,1%
Наборы реагентов MassARRAY позволяют настроить платформу под широкий диапазон задач — от рутинного генотипирования наследуемых вариантов до высокочувствительного поиска соматических мутаций и количественного анализа метилирования.
Запросить КПiPLEX Pro предназначена для мультиплексного анализа герминальных вариантов; iPLEX HS повышает чувствительность для соматических вариантов с низкой аллельной долей; UltraSEEK использует обогащение мутантных аллелей для ещё более чувствительного анализа; EpiTYPER/MassCLEAVE применяется после бисульфитной конверсии для количественного профилирования метилирования. В карточке наборы реагентов представлены как единая совместимая линейка, а конкретный набор выбирается по типу образца, панели и требуемой чувствительности.
iPLEX Pro поддерживает до 40-плексного анализа и обычно используется для вариантов с аллельной долей от 5–10% и выше. iPLEX HS рассчитана на обнаружение примерно от 1% VAF, а UltraSEEK — до 0,1% VAF при валидированных условиях. Фактический предел обнаружения зависит от матрицы, качества и количества ДНК, состава панели и аналитической валидации. Для текущих проектов также доступны реагенты Agena ClearSEEK; их включают после подтверждения совместимой панели и актуального каталожного номера.
iPLEX Pro
- Мультиплекс до 40 вариантов в реакции; реакция содержит все четыре нуклеотида в равной концентрации
- Для герминального генотипирования, скрининга носительства, валидации биомаркеров, фармакогенетики, племенного животноводства и валидации штаммов
- Чувствительность 5–10% по аллельной доле варианта
iPLEX HS и UltraSEEK
- iPLEX HS использует нуклеотиды в модифицированном соотношении с обогащением мутантных аллелей: чувствительность ≥1%, до 15 маркеров в реакции
- UltraSEEK детектирует только редкий/мутантный нуклеотид: чувствительность ≥0,1%, до 15 маркеров в реакции
- Образцы: гетерогенные солидные опухоли, тонкоигольная аспирация, циркулирующая опухолевая ДНК из плазмы
EpiTYPER / MassCLEAVE
- Количественный анализ метилирования CpG после бисульфитной конверсии образца
- Чувствительность выявления изменения метилирования — от 5%
Чувствительность и мультиплекс
| Параметр | iPLEX Pro | iPLEX HS | UltraSEEK | EpiTYPER (MassCLEAVE) |
|---|---|---|---|---|
| Предел обнаружения | 5–10% | ≥1% | ≥0,1% | от 5% (изменение метилирования) |
| Маркеров на реакцию | до 40 | до 15 | до 15 | — |
| Принцип реакции | все 4 нуклеотида в равной концентрации | нуклеотиды в модифицированном соотношении, обогащение мутантных аллелей | только редкий/мутантный нуклеотид | бисульфитная конверсия + расщепление MassCLEAVE |
Область применения
| Параметр | iPLEX Pro | iPLEX HS | UltraSEEK | EpiTYPER (MassCLEAVE) |
|---|---|---|---|---|
| Типы образцов | кровь, сыворотка, буккальные клетки, микродиссектированные и свежезамороженные опухолевые клетки, волосяные фолликулы, WGA ДНК | гетерогенные солидные опухоли, тонкоигольная аспирация, смеси семян | циркулирующая опухолевая и внеклеточная ДНК из плазмы | — |
| Типичные задачи | фармакогенетика, наследственные заболевания, валидация биомаркеров, племенное животноводство, валидация штаммов культур | соматические мутации, низкочастотные варианты, валидация находок NGS, скрининг ГМО | онкогенные маркеры резистентности и прогрессии, неинвазивное тестирование | количественное профилирование метилирования |